2,5" винт нужно ставить если корпус miniITX. Или если планируете в маленькое пространство все запихнуть. Если место позволяет , то без разницы. 3,5" даже лучше. Они высокоскоростные. Хотя и 2,5" я советовал бы брать 7200 об. в мин.