Можно две крыльчатки поставить. В меге еще 2 входа с прерываниями есть. Пролить обе крыльчатки шприцем, и определить количество импульсов на единицу объема. Реальный расход получаем вычитанием количества импульсов обратки из количества импульсов подачи.