Кажется, разобрался с косяком при встраивании приложений в CF.
При работе в расширенном режиме (запуск с ключом "-advsettings" или после удерживания плюса в настройках) диалог встраивания приложения выглядит по-другому, и приложение "не цепляется". Таким образом, для встраивания нового приложения необходимо запустить CF в обычном режиме и выполнить настройку. Затем, можно пользоваться и в расширенном режиме - встроенное приложение будет работать.
Диалоговое окно встраивания приложения в простом режиме:
Диалоговое окно встраивания приложения в расширенном режиме:
ЗЫ: В новой версии (2.1.1331) поправили эту ошибку.