странно... у меня все отлично.
Но есть другой трабл. Настройки сохраняются скриптом в settings.reg, т.к. образ WinCE 5.0 состояние сохранять не умеет. А потом при загрузки есть в этом файле 2 оч. длинных строчки на которых регедит ругается и приходится 2 раза жать OK, пока еще не нашел как с этим бороться...
Зато пока ни разу не вылезла повторная переиндексация. Может пофиксили...