в пункте 8 несовсем понятно - эти два АКБ между собой остались связаны общей зарядкой или нет, если нет то это может быть при включении через 1 АКБ часть тока блока питания PC протекала по экрану линейных проводов и создавала помеху, думай как вкрячить оптопару в ОС блока питания (полностью отцепить землю питания PC от земли питания БП) и проблема решена.