Ага! Всё понятно! Что и требовалось доказать! Смотри, когда Ты запитал от отдельных АКБ комп и усилок, ток питания компа протекал только по силовым проводам от АКБ. А когда всё запитано от одного АКБ, ток питания компа протекает и по проводам от блока питания компа и по оплётке линейных проводов от компа к усилку на АКБ, отсёда "хрю" и вылезало.
А если полностью расцепить землю в блоке питания как показано на следующем рисунке (правда это схемка от БП для усилка, но по такому же принципу можно соорудить для компа) , то не будет паразитной цепи для протекания тока через линейные провода. Идея в том, что-бы "0" компьютера стал свободно-плавающим, а когда ты его подключишь к усилку то "0" компа приобретёт потенциал усилка. Я схему Твоего БП не знаю, может там такое и нереализовать.