Отладка программы "на ходу" не предусмотрена."Свернуть все окна" - а это очень нужно, пусть даже при отладке.
Можно не запускать все проги. Обрати внимание на команду *.exeВедь это жрет память. Нельзя ли такие программы запускать через дополнительное меню при необходимости?