У меня обычные карты и 10километровки в одном атласе, в разных папках, т.е. индексируются вместе. Правда из 10км-к отсеивал нужные, как описывал Тут С тех пор ничего не вылетало и Новомичуринск находит без проблем.
PS Причем работает одинаково на обоих компах, как на домашнем так и в авто. Т.е. дело в какой то конкретно 10км-ке.