Я думал про двойной клик. Единственное что смутило - необходимость прокликивать каждое приложение. Это как раз тот случай, когда "одно на всех" упростит использование. С трудом представляю ситуацию, когда одно из приложений требует блокировки, а второе - нет. И число кликов возрастает соответственно числу приложений. Но все равно двойной клик лучше чем долгое удержание...
Что касается прорисовки немасштабируемых приложений, наверное можно действительно выводить уменьшенные скриншоты, а управлять только в развернутом режиме. Тут уж не до удобств - просто хоть бы работало.