Я тоже над этим думаю, подключайся:
http://www.compcar.ru/forum/showthread.php?t=6664

А по вопросу, микропроцессорные системы зажигания делают и на PIC16, и на ATMega8, в кАрдуине контроллер не слабее. А если нет проблем по нужному углу коленвала давать искру на нужную свечу - то не должно их быть и при открытии форсунки. Задача только обвязать датчики и исполнительные механизмы, а также оптимально реализовать алгоритмы управления.