И вот тут немного не понятно:
Какие файлы имеются в виду?PHP код:
Все, среда разработки стоит.
Теперь запускаем AVR Studio, в нем создаем AVR GCC проект.
Выбираем название для проекта и папку для местоположения.
Затем выбираем процессор AVR Simulator и AT Mega 168 или Mega 328
(в зависимости от вашей ардуины).
Теперь копируете в эту папку все выйлы из проекта Arduino.
И в какую именно папку?
У меня проект лежит в папке "C:\avr\nnnn\