Для того чтобы удалить этот вирус надо сначала почистить его код.
В файлах обычно Index.html или index.php надо в конце страницы искать беспорядочный код он может содержать ссылки вот пример его

<iframe src="http://******/" width=1 height=1></iframe> ) или подозрительный Javascript (содержит eval и набор «бессмысленных» символов или чисел — %0a%76%61%72%20%57%64%68%3d%27%64%65%39%33%36%66 или 121,101,101,104,97,97,46,114)

Так же он может прописаться и в базе данных.