У микрух преобразования как правило есть выводы Enabled. Они и используются в m2-atx.

5vsb берется не от 12 вольт, а от отдельного конвертера, это я точно помню. И у этого конвертера есть специальный вывод, на котором выводится - нормальное напряжение на выходе или нет. 12В появляется только когда pic подает на 15-ю ногу Vcc.