А может это по этой причине?
Замечание по использованию attachInterrupt
Внутри функции обработки прерывания не работает delay(), значения возвращаемые millis() не изменяются. Возможна потеря данный передаваемых по последовательному соединению (Serial data) в момент выполнения функциии обработки прерывания. Переменные, изменяемые в функции, должным быть объявлены как volatile.