Да, конечно, проще. Только лень всё переделывать
Скрипт же писался не сразу целиком, а от мелкого - только реакции на хоткеи, - постепенно обрастая дополнительным функционалом. Но разбивать его на отдельные скрипты смысла не имеет - каждый отдельный скрипт будет запускать по отдельному экземпляру autohotkey.exe, что в свете борьбы за экономию ресурсов не очень хорошо.