Итак, основным недостатком флешек в качестве системного диска является ограниченное количество циклов записи. Если данные на диске не очень важны то в случае сбоя можно тупо восстановить на домашнем компе из бекапа и вткнуть в CarPC новую флешку.

Но вот если данные таки важны, то можно использовать raid1 массив из 2 и более флешек. В случае Raid10 или 5 еще и скорость повысится вдвое.

Беда в том, что встроенные в маму контроллеры поддерживают Raid только для Sata, а Sata-CF переходники стоят дорого.
Порылся и нашел несколько дорогих и боьших PCI IDE raid контроллеров с поддержкой Raid5 и несколько дешевых с поддержкой raid 0,1,10,JBOB