Насколько я понял вот отсюда - http://playground.arduino.cc//Learning/Linux - и отсюда - https://wiki.archlinux.org/index.php/Arduino - ардуино под linux ставится всё с тем же ftdi usb to serial, и обращаться напрямую в USB0 не нужно. Вероятно, проблемы с драйверами.