Beard, есть два варианта решения. первый: в каждой программе (плагине и обработчике кнопок на ПК) прописать порт для своей ардуины. второй: все повесить на одну ардуину и написать программу обрабатывающую и кнопки, и управление реле. нечто подобное делал тут, правда кнопки не резистивные (легко редактируется, все равно под ардуино переписывать).