1. Обнуление БП и запуск системы происходит только после того, как убираю перемычку. Установив в любое положение система работает.
Обнулять нужно полным обестачиванием БП
В каком положении перемычка до и после обнуления?

2. Конденсатора нет, а можно об этом подробней.
Имел ввиду конденсатор который нужен для усилителя.

3. Сигнал измерял индикатором, после отключения АСС - 0.
индикатор 2в не будет показывать, но 2в не дадут БП выключится
попробуй после выключения АСС подключить АСС на общий провод (-12в)